据宇博智业市场研究中心了解，央行紧急暂停二维码支付、虚拟信用卡业务后，资本市场反应迅速。截至3月14日收盘，在港交所上市的腾讯股价大跌4.08%，报收564港元。A股市场上，与两家企业合作发行虚拟信用卡的中信银行股价下跌8.26%，报4.89元，直接临时停牌。此前因与腾讯和支付宝合作“试水”线下。
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二维码支付的零售业企业也被殃及：王府井跌2.24%，华联股份跌4.28%，天虹商场跌3.56%。
从腾讯和支付宝的合作伙伴的反馈来看，移动支付业务整体并未受到根本性影响，毕竟二维码支付仅是移动支付的一小部分。快的打车和嘀嘀打车均表示，业务不受影响。嘀嘀方面表示，该公司并未涉及二维码部分，而是用户手动输入金额再进行支付。快的方面则表示，用户主要采用的付款方式依然是内置支付宝功能，此次暂停业务不会影响到支付流程。
中国报告大厅、宇博智业市场研究员表示，对移动支付的前景依然保持乐观。移动支付对传统刷卡业务的冲击已不可阻挡，无卡技术一定是未来的发展趋势，尽管要经历一个比较长的博弈过程，但金融创新的脚步已无法停止。
一波未平，一波又起。3月15日，有媒体报道称，央行正就《支付机构网络支付业务管理办法》草案最后一次征求意见。该草案规定，个人支付账户转账单笔不超过1000元，年累计不能超过1万元;个人单笔消费不得超过5000元，月累计不能超过1万元。
中国报告大厅、宇博智业市场研究员表示，和暂停两项业务相比，如果该办法正式出台，将对网购、移动支付等应用场景带来更大的限制。
支付宝并未否认该草案，仅回应称：“请大家对监管机构也对我们保持信心与耐心，我们已经将相关意见反馈给了央行，并且在密切沟通之中。支付宝使用一切正常，余额宝使用一切正常。”这似乎又为第三方支付的未来蒙上了一层不确定色彩。
